Yo personalmente prefiero esta:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=51888

Y luego cambiar el recovery.
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=59948

Pero si en el paso sexto del primer tutorial poneis el recovery que tendrias que descargar en el segundo tutorial os ahorrariais el proceso del segundo tutorial.

Yo tengo hecho esto y nunca he perdido el root y he instalado de todo tipo de roms sin ningun problema.