Yo también tengo un ligero arañazo en la pantalla que le hice en un descuido con una tachuela del pantalón. Pero como se supone que el móvil viene con un protector de pantalla colocado, confío en que lo que se ha arañado es el protector, y que la pantalla sigue debajo intacta (además de ser más resistente que eso, supongo). No he respondido a tu pregunta, pero realmente no sé de qué material será la pantalla, según Sony es de un vidrio duro como para que no se arañe.
En cuanto a el contenido de la caja, a mí me venía todo eso, que compré el móvil libre. Pero he visto por el foro gente que dicen que al ser de un operador no les traía el protector de pantalla o las smart tags.