A lo mejor flasheando el kernel con el flasher que comparte JM con su rom Galaxy Nexus, podría ayudar las indicaciones para cambiar el CWM, aunque tiene que ser por lo que he leído con S-off, cosa que ya no teneis si lo habeis puesto ya en ON. Dice que arregla un problema que había relacionado con la carga de la batería, pero no sé exactamente el problema que cita, ya que no lo he tenido hasta ahora.
Por probar, a lo mejor se arregla lo del porcentaje de batería, no lo sé pero por hacer la prueba....
Probad donde dice TUTORIAL PARA CAMBIAR DE RECOVERY FACILMENTE (solo S-OFF):
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=260892