Yo lo que he hecho es instalar por un lado Mobipocket para la D2, y tambien la versión para PC.
En mi caso, los libros que queria probar estaban en formato PDF por lo que desde la aplicación para PC lo puedes abrir tal cual, y entonces tienes la opción de Enviar a la D2, para lo cual tienes de sincronizarte.
Cuando lo envia a la D2, internamente hace una conversion al formato interno que utiliza.
Espero haberte ayudado.
