Éste proceso yo no lo he hecho ya que tengo un sensación normal, pero creo que hay que ejecutar el programa de revolutionary con el teléfono arrancado normal. Se ejecuta después del segundo reinicio que se realiza al ejecutar la segunda parte de comandos, o sea, cuando se ha realizado el root temporal.Al ejecutar el revolutionary, el mismo programa volverá a reiniciar el terminal para que ingresos el código para realizar el S-OFF, y una vez hayas reiniciado de nuevo el teléfono en modo normal introduces el comando para quitar el root temporal.
Con eso ya tendrías la parte del S-OFF completada.
Luego tendrías que hacer el root permanente, o si vas a instalar una ROM cocinada seguir las indicaciones de los requisitos (Firmware, 4Ext Recovery, etc.).
No dudes en preguntar si hay algo que no termines de entender, intentaré ayudarte en lo que pueda. Tal vez tarde un poco en responderte ya que últimamente no me conecto muy a menudo, pero si no soy yo será algún compañero.
Saludos.