No tienes que tener ningún problema. (Wipe Data y Cache, son opcionales en Mobile ODIN)
Yo lo hice por ODIN PC e hice los wipes con el recovery del CF ROOT (en teoría es seguro).
Si optimizas la ROM con los métodos que ha posteado @yocasta veras que el rendimiento sin ser el de CM9/Paranoid es mas que correcto.
Saludos