No se hasta que punto el no cargar la batería antes de empezar a utilizar el móvil puede hacer que la batería se vaya al traste en los primeros usos.
En mi caso, yo hice lo mismo que tú, empecé a utilizar el móvil hasta que casi me fundí la batería y entonces fue cuando le hice la carga completa, y creo que la duración de mi batería es de lo más normal.
Respcto a la app que mencionas de battery calibrator, ¿cual es el procedimiento para calibrar la batería?, ¿que valores tienes tú?.