¿Has probado a reiniciar el terminal después de instalar la ROM, seguir todos los pasos del primer arranque y luego volver a probar a entrar en recovery para meter el FD on?
A mi me pasó esto que comentas cuando intenté flashear los Extras y el FD on justo después de instalar la ROM, sin salir del CWM. Pero reiniciando el teléfono ya pude instalarlos sin problemas.
