Del backup para llevarlo a la nueva rom no te sabría decir, pero todo aquello que no esté en la SD (como contactos, mensajes, partidas guardadas... ojo, hay partidas guardadas que están en la SD, esas sí que se salvan) se borra. Me pasó a mi por investigar sin demasiados conocimientos
Desde el recovery puedes hacer un backup con nandroid, te guarda toda la rom anterior con todos sus datos. Es muy útil
