Tengo casi el mismo problema que vos, solo que no es a los 5 segundos, es completamente aleatorio y en cualquier programa, incluso escribiendo sms, realmente muy molesto..
Tengo la misma rom que vos y de paso te dejo una lista de los programas que tengo instalados en mi omnia, si vos tenes alguno de los mismo avisame y vemos cual es el que puede estar dando el fucking problema..
Tome Raider v3.62b ESP
Tcpmp Omnia Phenom 2 Plus Finger Menu
SpbBackup2
SkypeMobile
Spb.Online.Games.v1.1
Skyfire-PPC
quickmenu2.8
OmniaTHREAD
MoDaCo.OmniaSIP
Facebook_v1.0.0.7p
BW_Bluetooth_OBEX_Fix
BsB
Ram Sweeper1.2
Adryn Taskswitcher Killer
Adobe
Pdf Reader LE 2.5
ThumbCal.v1.3.4
Spb.Traveler.v2.5.0.Build.2440
sktools
S2P-0.58-QVGA
Resco_Audio_Recorder_v4.51
Resco.Utility.Package.v6.57
Pocket.Controller.Pro.v6.02
Omnytex.Electro.v1.2.All.PPC.
M2D V3.5-peterking
G-alarm
Calc.Pro.v.2.7.7
Garmin
Saludos!