Pues a mi nunca me ha dado ningun problema al restaurar ninguna aplicación con el Titanium, ni tampoco al desistalar las aplicaciones stock (tipo Bolsa, etc...), lo unico que me ha pasado ha sido con la Genesis, que al arrancar el Titanium me dice que mi ID de dispositivo a cambiado y que si quiero dejarla así o restaurar la anterior, pero nada de reinicios raros