Una cosa es la fuente de sistema y otra fuente instalada como apk... Si es una apk como es el caso de la choco esa que dices, se seleccionan desde ajustes, pantalla, definir fuente. Pero no cambian la fuente de absolutamente todo... Aguas cosas como navegador, market, etc siguen usando la fuente de sistema que esta en la ruta system, font. Si quieres que te cambie la fuente en todos los lados tienes que cambiar la fuente de sistema, y para lo cual obviamente hay que ser root.
Tienes una app en market que se llama rom toolbox que creo que cambia la fuente de sistema dejando que la elijas desde una colección bastante extensa que tiene.
Espero que te sirva.