Hola,
en este post:
http://ubuntuforums.org/showthread.p...ht=fuse_hidden
he encontrado esto:
Re: Help NTFS-3G .fuse_hidden files You can safely ignore .fuse_hiddenXXXX files. It means a file was deleted but there is at least one software which is still using it, so it can't be removed permanently. It will be done automatically when the relevant software stops using the file or exists. Such files are always gone after umount/reboot. This is how Linux and any Unix works but only FUSE exposes these files to the user. In the future we may try to make them unvisible but that's not very simple.
Desde mi humilde inglés entiendo que es una característica del sistema FUSE de linux (
http://es.wikipedia.org/wiki/FUSE_%28Linux%29), que cuando borras un archivo realmente no lo borra físicamente si hay algún programa que lo está usando, entiendo también que el archivo debería borrarse físicamente cuando el programa que tiene apuntado que lo utiliza deje de hacerlo.
Espero haberte ayudado olysno.