Vamos a ver, si ya actualizaste por PCC a la 4.0.4 no podrás hacerte root con el script.
Primero debes flashearle el kernel de la 4.0.3,
Kernel LT18i 4.1.A.0.562 , y luego hacer los pasos para hacerte root. Una vez que hayas logrado el root debes volver a flashear el kernel de la 4.0.4,
Kernel LT15i 4.1.B.0.431