Subela como una rama diferente, y así la podemos probar ;)
Si por ahora tienes 2 aplis diferentes, una para "phone" y otra para "tablet", creo que te valdría la pena poner una condición y en función de cual sea, que te cargue 1 código u otro, de modo que la misma apli se valdría por si sola para cargar el contenido necesario.
Por mi experiencia colaborando en MerkaMarket, veo que vale más la pena unificarlo usando herramientas externas como ActionBarSherlock, que te permite que el mismo código sirva para prácticamente todas las versiones.