Tienes infinidad de launchers en el market, y en todos ellos te permitirá cambiar el fondo del box de aplicaciones o ponerlo transparente. Y si aún quieres ir más allá en la personalización puedes cambiar de Rom. En Android difícil es encontrar algo que no se pueda hacer a modo de personalización. Eso sí, el launcher de Sense no permite mucha cosa, aunque es muy bueno si te gusta tal cual
Algunos launchers que te recomiendo son:
launcher pro
go launcher ex
adw launcher
Holo launcher
Y un programa para cambiar entre launchers o volver a Sense:
Home switcher