Pues veras, toqueteando por la rom encontre que llevaba integrados los scripst de gk, asi que ni intente meterle el link2sd, le puse el a2sdgui directamente, sin haberle activado los scripts por el link2sd (nose si me explico...) que tal vez sea eso lo que te esta fallando.. Cuando el programa inicio ya estaba marcada la casilla del swap (en mi caso al particionar la tarjeta hize una particion swap tambien) asi que primero marque zipaling, y despues la pasarlas a la sd, reinicio, y todo funcionando. Espero que te sirva de ayuda.
Saludos