Muchas gracias, he cogido el resto de otra ROM para ir viendo, y solo he modificado algunas cosillas del script. La ROM funciona mas o menos bien.
Ahora he intentado extraer el system.fex de una actualización nueva que ha salido, y al pasarla por el Convert_sgs2img me da "error header".
Lo curioso es que cogido una custom de otro cocinero, y el fichero system.fex ocupa exactamente lo mismo que el del la ROM original, 409.600 kb.
Me da que pensar, no he conseguido encontrar referencia alguna a este error.