He vuelto a CM9... y reconoce la memoria interna como lo que es, y la SD externa, como externa (en Almacenamiento, en las opciones, se puede ver esto perfectamente).
He flasheado de nuevo esta Paranoid... y efectivamente, es una paranoya. Te metes en Almacenamiento, y tienes la SD externa como si fuera la interna. Un ejemplo claro es que te cre en la SD externa (en un explorador de archivos lo puedes comprobar) un montón de carpetas de Android, y de aplicaciones que antes no estaban.
Otro ejemplo... al usar AirDroid, arriba a la derecha de la pantalla del navegador en el PC, aparece tanto la memoria del teléfono como la interna, de 16GB... pues ahora aparece que tengo 32GB!!! (que es el tamaño de mi SD externa).
Vamos, que te deja los 16GB de memoria interna del teléfono prácticamente sin uso...