Pues las apps hacen eso. Piden permisos al instalarse, si se los diste ya no te van a preguntar.
Velo asi, las apps funcionan como cuentas de usuario en tu móvil. Si a un usuario le diste permisos para cambiar el estado de WiFi, seguro q en algún momento lo hacen.
Si eres paranoico respecto a la información privada checa también la app pdroid y su documentación.