Hola a mi me sucedio algo parecido a lo que creo entender que tu comentas yo tambien uso win 7 64 bits . Prueva haber si te funciona siguiendo estos pasos que explica el compañero
tutorial del compañero kastell . aqui el enlace : http://www.htcmania.com/showthread.php?t=357860&page=5
1º Desinstala el PC Companion y dentro del flashtools hay una carpeta que pone "drivers", ahí hay un instalador .exe que te instala muchos drivers para casi todos los dispositivos de Sony y alguno más genérico "adb bootloader", etc. Selecciona bien que te meta los drivers para el Xperia S (que lo han añadido en la última versión de flashtool). Una vez hecho esto, reinicia el pc para que inicies bien con los drivers nuevos instalados.
2º Asegúrate en el teléfono tener ajustes--aplicaciones-desarrollo--depuración usb "Activado" y marca también "ubicaciones simuladas".
3º Una vez hecho esto, apaga el teléfono y arranca el programa flashtool, sigue los pasos para meter un firmware y cuando te salga la pantalla con las animaciones para que conectes el teléfono en modo "flasheo", solo en ese momento, conecta el usb al teléfono con la tecla - Volumen pulsada.
4º Si es la primera vez que detecta el teléfono en modo para "flashear", igual te sale el mensaje para instalar dispositivo nuevo en windows, si es así, tendrás que dejar que termine de instalar el driver, y una vez finalice, tendrás que desconectar el teléfono, cerrar el flashtool y volver a iniciar el flashtool para llegar a la anterior pantalla otra vez, en ese momento vuelve a conectar el móvil en modo "flasheo" y ésta vez debería de reconocerte el flashtool ya a tu Xperia sin problemas y empezar a flashear la rom, una vez terminado correctamente déjale su tiempo, se reiniciará el teléfono y te aparecerá el nuevo firmware que hayas metido.
Puede ser que te falle el java 64 bits, está más depurado todo a 32bits, yo de hecho, uso el java de 32 bits en Windows7 64bits, y no tengo problemas de eso.
Tambiente te dejo el link donde el comañero
Yacandu te explica de donde descargar el flashtools y como isntalarlo y como cambiarle el firm. La explicacion esta al final de este post
http://www.htcmania.com/showpost.php...46&postcount=2 .Si tienes alguda duda mas , pregunta haber si entre todos te podemos ayudar suerte
( a mi tambien me costo un monton para que funcionase pero al final lo consegui )
