Para quitar el sonido de batería baja tienes que renombrar o borrar estos dos archivos:
-system/media/audio/ui/TW_Battery_caution.ogg
-system/media/audio/ui/TW_Low_Battery.ogg
Para el mensaje tienes que editar el SystemUI.apk o bien instalar una ROM cocinada que ya lo traiga hecho.
Para más info pásate por aquí:
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=1234738