Esta claro que las CM están más limpias y liberan más memoria, pero si con titanium (por poner un ejemplo) congelas/desinstalas las aplicaciones que no te gustan y añades el launcher que te agrade, pues, a mi juicio, siempre será mas estable y fiable que las cocinadas, partiendo de que la que lleva de origen está hecha adrede para el teléfono.
Es mi punto de vista y he probado mucho.
Saludos.