1º, la fat32 no hace falta formatearla... quizá si la ext3. Si las hiciste en ese orden no deberías tener ningun problema. Con respecto al app2sd... sin saber cual fue el error que te salió es dificil decir que es lo que pudo pasar o cual es la raiz del problema. En cualquier caso puedes probar a mediante un liveCD de ubuntu, formatear las particiones ext3 y linux-swap y probar de nuevo a hacer el app2sd, te recuerdo q no es aconsejable superar 1.5 Gb en la partición ext3, con una de 500 u 800 Mb es suficiente.