Yo uso el DDX para extraer todo el codigo de un odex y va de perlas (no se si es lo que quieres).
Bajate el baksmali que te he colgado y usa el siguiente comando:
java -jar ddx1.4.jar -d <directorio_salida> <ArchivoOdex>
Ejemplo:
java -jar ddx1.4.jar -d C:/HtcMusic/ HtcMusic.odex
Espero que te sirva.
Saludos!