Yo lo hago así de completo, solo cuando cambio de cocinero. Si solo cambio de versión (ej. Ahora de 1.6 a 2.0)
Hago:
1- backup y copia de archivos rom/scripts
2- partition a 200 (solo si la nueva v. Requiere una superior a la que tenga) si pide 165 y he tenido algún reinicio o cosas raras. Yo a 200
3- batería a full y ya no conecto mas con pc
4- full wipe (los 3, porque nunca me ha funcionado el sistema upgrade)
5- flash rom
6- reinicio y entro sin configurar nada. Solo el que arranca al inicio pero omitiendo cuenta Google.
7- nuevo reinicio para instalar script sd + fix permitions
8- entro ya y configuro cuentas, settings, instalo todas las aplis que ocupo y restauro los backups .
9- último reinicio y ya esta
[cortito que va desde el móvil]