Lo del setcpu muy posible venga por que:
A - has puesto un mínimo de velocidad del procesador muy bajo. ( Súbelo)
B - lo has puesto con el kernel de serie. ( Cambia de kernel)
Y ni se te ocurra marcar la opción de "Set on boot" por que te entrará en un bucle de reinicios del que sólo saldrá con un reset total. No hasta que vas que funciona bien.
Enviado desde el trono de pensar, usando una escobilla de doble núcleo.