Yo también estoy con el mismo problema, sobretodo con la tecla buscar y atrás.
He probado diversos programas que simulan las teclas en la pantalla pero al final todos acaban estorbando o son de difícil acceso.
Lo ideal sería tener la botonera virtual del Galaxy Nexus en la parte de abajo de nuestras pantallas, siempre visible y sacrificando una porción pequeña de la pantalla de la Desire.