Yo cada vez que flasheo dejo vacia la SD interna, solo dejo en ella el archivo que voy a flashear, apago el movil, quito la SIM y la SD externa, reinicio en modo flash, hago los 3 wipes y luego flasheo el archivo en cuestion. Tu sigues esos pasos?
De todas formas si no se te arregla podias probar a hacer la instalacion limpia desde la JVU 2.3.6.
