¿Puedes reproducir los archivos si los abres desde el QuickPic? o lo que te pasa es que no te aparecen en la lista de archivos del MX?
Si es lo segundo: en el MX pulsa menú y en "Carpetas de vídeo" elige las carpetas donde tienes guardados los archivos. En "Extensiones de archivo" comprueba que tengas "MKV", si no lo tienes añádelo.