A lo primero, cambiando el Bootanimation, pero hay que ser root para hacerlo o desde aplicaciones tipo ROMToolbox, pero idem.
A lo segundo create una carpeta en la sd interna con estos nombres y ruta:
media/audio/notifications y ahi metes las canciones que quieras para seleccionarlas como notificaciones.
Para alarmas: media/audio/alarms
Para tonos de llamadas: media/audio/ringtones