El problema es que si pones el archivo .nomedia en la carpeta del álbum de música que es donde estar el cover del álbum, tampoco te va a salir la música en el reproductor, la única solución es eliminarlos. Si tienes windows conecta el telefono como almacenamiento masico, ve a la carpeta donde tengas la música, (por ejemplo F:/musica) y desde el explorador de archivos de windows, arriba a la derecha te da la opción de buscar, pues pones *.jpg y te saldran todos los jpg que hay dentro de la carpeta música, los seleccionas todos (CTRL+E) y los borras. Es la opción más fácil
Saludos