Hola:
Bueno, pues pongo la solución por si alguien más le pasa. Ni restaurando los valores de fábrica desde el menú de android ni con la opción wipe se arregló el asunto.
Resulta que faltaban por ejecutar los puntos 8 y 9 del siguiente manual:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=51888
(creo que había dos versiones del manual para ser root, y yo hice la que se quedaba en el punto 7).
Ya está todo solucionado y funcionando a la perfección.
Saludos.