Creo que sé cual es tu problema.
La rom original era de stock no? con formato de archivos rfs?
Y las custom rom eran de formato ext4 no?
Si instalas sobre una rom una custom rom, y despues quieres volver la stock mediante un backup no puedes, hay como un conflicto (imagino yo) de archivos entre ext4 y rfs, y se qda en bootloop de manera infinita.
Modo de resolverlo?
Coge odin, instala la stock rom que tenias (ejemplo, ks2 libre 2.3.5 si era esa), instala el clock world mod del que hiciste copia (las copias de 4 no van con el CWM5 y viceversa) y tras instalar el que necesites, restaura, y da x seguro q si q te arrancará
suerte!!