Cuando instalas una nueva rom se borra todo lo que tenias antes, para salvar tu sistema y/o aplicaciones puedes ocupar estos metodos:
-Creas un backup en CWM para guardar todo el sistema y cuando quieras volver a la rom que tenias solo restauras y todo normal como antes. (este metodo es el mejor)
-Si usas Titanium backup puedes copiar las aplicaciones que quieras y cuando instales una nueva rom restauras las aplicaciones que copiaste y apareceran ya instaladas en la nueva rom.
saludos!!
