normalmente no hay diferencia, pero algunos necesitan ir en la memoria principal.
a mi me esta pasando que la memoria principal me baja muy rapido por culpa del cache del opera, asi que estoy instalando todo lo que pueso (que es casi todo) en la memoria de 4 GB.
uno de los problemas de instalar en la memoria de 4GB es que cuando conectas al pc en modo "disco externo", la memoria de 4GB se desactiva para la pda, con lo que los programas instalados en esa memoria no funcionaran durante ese tiempo