Bueno, después de mucho mirar por otros foros, problema resuelto, únicamente era que con Windows Mobile 6 no se puede instalar por ahora en la memoria externa (en el caso de la Diamond interna) sino en la memoria del dispositivo. Funcionando perfectamente, además, me he bajado la versión 2007 de prueba de su web
http://www.medigest.com/web/medimecum y siguiendo exactamente los mismos pasos que con la de 2006 que hay aquí colgada, funciona de maravilla.