Tu problema debe estar relacionado con un mal funcionamiento del ActiveSync... que se te desconecte/conecte cuando quiere es un mal síntoma... yo probaría a desinstalarlo y volverlo a instalar, a eliminar temporalmente el antivirus/firewall... porque el ActiveSync es muy estable en condiciones normales.
De todas formas para instalar software siempre puedes optar por hacerlo a través del .cab (copiándolo en la PDA), casi todos los programas están disponibles en formato .exe y formato .cab y en el caso que solo lo tengas en formato .exe casi siempre es fácil extraer el .cab que hay en su interior.
Saludos