Mira esta página a ver si te vale este programa, en las caracteristicas dice tener multiples alarmas y cronometros (aunque no pone cuantas):
http://www.htcmania.com/showthread.php?p=169731
Edito: Este sería para controlar varios a la vez, si lo que quieres es controlar uno solo tambien tienes el Fizz Alarmas, en este puedes controlar cada vuelta y te queda registrado el total y parcial de cada vuelta, en este ultimo he realizado hasta 50 parciales (pero podrian ser más)
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=16083&page=2