tu problema es el siguiente
Puede ser causado por algún task taskiller.
otra cosa lo puedes tener mal configurado
Ajustes -> Cuentas y sincornizacion: "Datos de referencia" y "Sinc. automatica" tienen que estar activados y aparte mas abajo donde esta el icono del Whatsapp tiene que estar el simbolo de sincronizacion en verde.
Por otro lado, cuando te metes en la aplicaciones de Whatsapp en Menu->Configuracion->Configuracion de notificacion puedes ver los tipos de notificacion del whatsapp: que te vibre cuando te llegue un mensaje, que te salga una ventana emergente
o prueba esta aplicacion SayMyName suerte