Yo perdona pero difiero muy mucho en esto. Si no tienes el superuser no te pregunta por lo que nunca sabrás cuando una app está accediendo a root y cuando no.
Es impensable tener un sistema linux (y android es linux) sin tener una barrera de administración que es el usuario administrador y que le da esos privilegios, y esa barrera es mas o menos el superuser.apk

Un ejemplo, ahora cualquier amigo al que le actualices a esa rom podra borrar cualquier cosa sin saberlo porque su aplicacion root favorita no pedira los permisos previos. Antes yo les dejaba los permisos denegados por defecto, ahora ya no puedo.

Otro ejemplo, el Blackmarket, intenta cada vez que bajas una aplicacion cualquiera acceder a root.. para qué? no lo sé pero muy necesario no debe ser y sobre todo fiable menos aun. Yo le pongo por defecto que no y tan tranquilo. De esta nueva manera, el blackmarket actuará en el root como le de la gana sin ninguna restricción y vete tu a saber que hará... Y por supuesto si no tuvieramos el superuser.apk tampoco nos enteraríamos que está entrando en modo superusuario. Y de mas está decir que en sus permisos no te indica que tiene funciones de root.

Creo que son dos ejemplo claros.

Android es libertad, o eso se supone. No entiendo por que perder esta libertad de elegir y ceder esos privilegios nuestros de decidir al sistema.

Lo siento pero me parece un PELIGRO no tener un control sobre que accede y que no a nuestro root.. y si no tiempo al tiempo.