A ver por partes, el kernel CF Root solo se necesita por si quieres hacer nandroid, instalar alguna modificación via .zip o así ya que, para hacer esto, se crean incompatibilidades con CF Root, por lo tanto se flashea en 5 minutos el abyss 3.9 (el 4,1 red touch va mal con esta rom) , y una vez echo, se vuelve al CF Root. Pero si de momento no tienes que hacer nada de nandroid y tal ni instalar themes, no lo necesitas, ya que la propia ROM ya lo trae incorporado.
la descarga del CF_root solo se usa para si tienes que hacer el punto 8 de las instrucciones