Ya he cambiado el kernel y ajustado los valores de la CPU, a ver si aguanta un poquito más la batería je je. Lo he hecho como comentas, he limpiado el kernel desde el recovery y luego he flasheado el kernel nuevo, lo raro es que al iniciar por defecto me seguía apareciendo la CPU a 1,6 GHz pero con el No-Frills CPU Control me ha dejado cambiar los valores sin problemas.
Saludos.