Yo he probado a hacer alguna llamada por 3G de estrangis con Movistar y tampoco me han cobrado nada. Lo que no sé es si te pegarán el sablazo si lo haces con regularidad.
En cuanto a las apps dependes bastante del resto de la gente pero a mí la que más me gustan son CSipSimple (open source, potentísima) y Viber.