Con la batería llena puedes hacer un wipe battery lo que te borrará los "perfiles" de la batería.Luego lo usas hasta que se acabe de todo y la vuelves a cargar.Listo te tendría que funcionar.
Aparte hay una aplicación que ya es para eso y se lama BateryCalibration y para usarla,una vez la batería a tope,pulsas en calibrar y vas a oir un sonido.Cierras la aplicación y haces lo mismo que te he comentado antes.Luego ya vuelves a cargarla y creo que ya no tendrás ese problema.
Por aquí ya lo han comentado:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=280016
Fíjate en el comentario de Ruymanca.
Un saludo