Yo no le he cambiado permisos, solo lo he sustituido.
Esos permisos 0644 a qué corresponden, uso el ES Explorer y los permisos pone rw- rw- rw-.
El hosts de las nightly no quita publicidad, por eso he puesto el del kernel nova, no sólo es para cuando navegas, también quita la publicidad de las aplicaciones.
El hilo del kernel nova es este:
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=1276645