Hola
aragones.
A mí me ha pasado eso en alguna ocasión...
Si tienes un recovery como el ClockWorkMod, y una copia de seguridad, será fácil restaurar el sistema operativo. Si no tienes copia de segudidad, tendrás que instalar de nuevo una ROM y configurar todo el sistema (es en lo que estoy yo ahora...

)
PASOS:
Tienes que encender el movil pulsando la tecla VOL- al mismo tiempo, durante un par de segundos, y soltarlas.
Arrancarás el movil en el FASTBOOT, que te permitirá entrar en el recovery (imagino que tendrás un recovery instalado si eres ROOT). Desde dentro del recovery, hay una opción que pone "RESTORE AND BACKUP". Si has sido previsor, y has hecho una copia de seguridad de tu sistema cuando éste funcionaba correctamtne, ahora es el momento de utilizarlo y reinstalar el sistema desde el RESTORE.
Si no, otra opción que se me ocurre es copiar una nueva ROM en formato ZIP en la tarjeta SD, y desde el msimo recovery, "instalar zip desde SD" o algo así, e instalas la ROM de nuevo. PERDERÁS LOS DATOS DE USUARIO (excepto fotos, videos, musica y tal.... pero haz una copia de la tarjeta igualmente).
Antes de instalar las ROMs, o de restaurarlas, yo vacio todas las cachés que veo en el Recovery...
AUNQUE COMO NO SOY EXPERTO EN EL TEMA, ESPERA QUE RESPONDA ALGUIEN QUE ENTIENDA BIEN EL TEMA Y CONFIRME QUE LO QUE HE DICHO NO ES NINGUNA SALVAJADA!!! No sea que me odies de por vida x intentar ayudarte!!!