Exacto, no te preocupes, whatsapp crea una carpeta en la SD, que si no la formateas, al volver a instalar whatsapp, nada mas arrancarlo, te dira si quieres restaurar tus conversaciones, le das a Ok y ya está.
Eso si, si quieres tenerlo tal y como lo tenias antes de flashear, debes irte a whatsapp y hacerle una copia del historial antes de flashear, ya que whatsapp crea copias cada cierto tiempo automaticamente, por lo que algunas frases de las ultimas podrian faltar, por eso haz una manual antes de flashear.
Saludos
Enviado desde mi HTC Wildfire usando Tapatalk