Según tengo entendido el busybox es un conjunto de aplicaciones de linux o de unix adaptadas a android. Estas sirven para según que cosas en la consola, por ejemplo copiar, mover, cambiar permisos, añadir usuarios, grupos, ping, sed, grep ... .
Mi suposición de porqué va mejor es que el paquete su que es el que da permisos de superusuario (el programa, y no la apk superuser que muestra a quien se le ha dado permisos) debe usar algunos de estos comandos y al no poder usarlos inestabiliza el sistema y gasta recursos. Digamos que el root funciona pero no eficientemente. Esto que he dicho es lo que me supongo yo y desde luego no lo se a ciencia cierta no me he metido tanto con eso.
basta con googlear para encontrar la página oficial de busybox
http://busybox.net/about.html