a mi me pasa lo mismo aunque yo no necesito sacar la bateria, cada vez que flasheo cualquier cosa no me pasa del bootanimation, mantengo pulsado 10 seg el boton de encendido y se apaga, al volver a encenderlo ya me arranca bien incluso mas rapido que normalmente y esta todo cambiado, igual te sirve eso que quitar la bateria es un poco drastico, lo probaste?
